Село Звериноголовское — одно из старейших поселений на юге Южного Зауралья. Первоначально была основана крепость на левом берегу Тобола у озера Бакланское. Это был передовой военно-стратегический укрепленный пункт на границе Азии. Крепость Бакланская была построена в 1717 году и просуществовала до строительства Звериноголовской крепости.

О её переносе пишет Петр Симон Паллас в своей работе «Путешествие по разным местам Российского государства»: «…крепость ради случающихся наводнений на другое место перенесенная. В двух верстах от оного истока видны и следы перенесенной крепости, которая опять с учреждением новой линии сломана (имеется в виду новая Сибирская оборонительная линия, возведённая для обеспечения защиты от набегов кочевников) и перенесена в нынешнюю Звериноголовскую крепость, сооруженную четырьмя верстами с половиною выше по Тоболу». Переносом занимались в 1743 году под контролем оренбургского губернатора И. И. Неплюева.

Существует три версии возникновения названия.

Первый вариант легенды записал известный уральский краевед В. П. Бирюков. В нем говорится, что первые русские пришельцы в здешние места увидели в осыпях правого возвышенного берега Тобола небывалой величины «голову какого-то дикого зверя», похожую на череп мамонта, вымытый водой. Отсюда и пошло название урочища «Звериная голова».

По второй легенде, в то отдаленное от нас время на правом берегу Тобола рос от устья реки Убаган до устья реки Алабуги труднопроходимый бор со столетними соснами. При постройке крепости лес вырубался и шел как строительный материал. Однажды лесорубы-разведчики нашли в лесу череп какого-то большого зверя, находка и подсказала им название крепости.

По третьей версии, при переносе крепости одним из первых сооружений была церковь. При рытье котлована землекопы обнаружили неизвестного зверя.